铁路之事之后，便是财政金融案。1906年全国的财政收入为一亿八千万两，但是支出呢。则在一亿九千万两，加上庚子之后的亏欠。财政赤字几近四千万两[注2]。而按照内阁计划，不说其他，就是陆海两军的费用就比前一年增加了一千五百万两，这其中有一千万两是用于新军扩军的，除了禁卫军两个镇之外，其他都用于满蒙新军，其他各省的新军暂不编练；另外的五百两则用于海军，这是新任海军大臣载洵提出的海军七年规划，计划七年时间投入五千万两重建海军，其中三千五百万两从国家预算里出，每年五百万两；另外一千五百万两从内廷用度里扣，每年两百万两。
建军就要花钱，再加上办新学、修铁路，建巡警、兴实业，1908年的预算为两亿三千万两，比06年多了四千万两，多了就多了，钱总是要收上来的，是以田赋、盐税、厘金、这几个大头都是要想办法增收。除了加税，还有一个则是进行币制改革。
04年的时候美国人精奇就建议中国由银本位制，改为金汇兑本位制，但是湖广总督张之洞极力反对，其理由一为，币改为外国人主导，是洋人控制大清财政的阴谋，其二则是对金汇兑本位故意装做不解，质问金银比价定位1：32是否可以保持不变。其中最大的奥妙在于，一旦国家币改，则全国各地的铸币厂都会被度支部接管，每年一千八百万两[注：3]的铜元盈利将完全失去，作为全国最大的武昌造币厂，其盈利是极为丰厚的，所以张之洞极力反对币改。同时，如果进行币改，很多陋规带来的收益就失去，比如收取田赋，百姓一般都是缴纳铜钱，按照时价，一千四百文等于一两，但县官收税的时候，则强制定为两千八百文为一两，再加上惯有的火耗，对于各地的大小官员来说，这是一笔巨大的收益，所以当年精奇的币改因为地方的集体反对而被慈禧作罢。
慈禧作罢的事情，光绪却并不认输，现在的计划和以往的银本位换金汇兑本位不同，其还是持银本位，不过不再是张之洞所极力主张的一两制银元，而是将铸造七钱二分重的银元，同时禁止各省擅自铸币，只有天津造币总厂、湖北、江苏两地分厂有权铸造‘大清银币’；而铜元，虽然在05年就严旨不得滥造，但现在越发造的泛滥，故此，铜元的铸造权也收回中央，由天津造币厂和湖北、江苏两地分厂铸造；最后就是纸币，度支部严令各省官商行号未发纸币者不准发行，已发行者应逐渐回收，并提供一定的储备金，以备随时核查。
整个财政金融案，除了加税就是和各地督抚和